RevvingUpkj A menos que tenha algum problema com o vídeo em si (pode ser, alguns formatos de vídeo não são muito bem suportados, principalmente em navegadores de celular), não consigo reproduzir seu problema.
Acabei de testar no Chrome mobile no Android:
1. Carrego um arquivo
2. Carrego o mesmo arquivo de novo (aí ficam dois na fila)
3. Edito os timestamps do primeiro arquivo da fila, coloco todos os timestamps na primeira metade do vídeo e salvo
4. Edito os timestamps do segundo arquivo da fila, coloco os timestamps na segunda metade e salvo
5. Começo o processamento.
Me dá duas saídas diferentes:



Não fiz 48 células, mas duvido que mude alguma coisa. Repara que você
PRECISA especificar todos os marcadores, se você especificar só alguns, os que faltam são preenchidos automaticamente e pegos dos padrões a partir do começo do arquivo, então talvez esse tenha sido seu problema? Se você só precisa de 24 células em cada arquivo, faça a grade com 24 células

O VidGrid não suporta grades "incompletas", ele avisa dos marcadores "auto" se você salvar menos do que o número esperado, e o número de marcadores fica em vermelho no editor de timestamps (e o layout da grade mostra as células que faltam):
